Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste qui se développe au sein des organismes immunodéprimés. En particulier, P. aeruginosa colonise, sous la forme de biofilm les poumons des personnes atteintes de mucoviscidose.

Mon étude vise à comparer le contenu protéique (protéome) des cellules " libres " (dans un milieu liquide) à celui des cellules " immobilisées ". La technique utilisée est l'électrophorèse bidimensionnelle qui permet de visualiser 15% du protéome total théorique de P. aeruginosa.

La fixation des bactéries se fait sur différents supports : des billes d'argile et de la laine de verre pour les biofilms " naturels ", et dans un gel d'agar pour les biofilms " artificiels ".

Ainsi, nous essayons d'identifier les modifications induites par l'immobilisation sur le protéome (comparaison culture libre / culture immobilisée), de voir si le support a lui-même une influence (différences entre laine de verre et billes d'argile), et de valider un système modèle pour l'étude des biofilms (différences entre l'agar et laine de verre / billes d'argile). De plus, nous essayons de mettre en évidence l'existence de protéines spécifiques de l'état " immobilisé " qui pourront servir de cibles moléculaires à de futurs médicaments.

La microscopie électronique à balayage a été utilisée afin d'observer l'aspect général des microcolonies bactériennes et leur organisation sur les billes d'argile et les fibres de la laine de verre. Cette visualisation pouvant illustrer les différences observées lors de l'étude des protéomes.