Nicolas VERGNE

Articles

Drifting Markov Models with Polynomial Drift and Applications to DNA Sequences. N. Vergne. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 7 2008. [PDF]

Poisson approximation for search of rare words in DNA sequences. N. Vergne and M. Abadi. ALEA 4 2008. [PDF]

Sharp error for point-wise Poisson approximations in mixing processes. M. Abadi and N. Vergne. Nonlinearity 21 2008. [PDF]

Sharp error terms for return time statistics under mixing conditions. M. Abadi and N. Vergne. Journal of Theoretical Probability 22 2009. [PDF]

Coalescent-based DNA barcoding: multilocus analysis and robustness. O. David, C. Larédo, R. Leblois, B. Schaeffer and N. Vergne . Journal of Computational Biology 19 2012. [PDF] [Supp_PDF]

Articles soumis ou en préparation

Pattern statistics according to drifting Markov models. N. Vergne and G. Nuel.

Drifting Markov models: Polynomial Splines. Applications to DNA sequences. N. Vergne and M. Termier.

Posters

Les chaînes de Markov régulées. N. Vergne. JOBIM (Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques). Juillet 2005, à Lyon.

Drifting Markov models. N. Vergne. ECCB (European Conference in Computational Biology). Septembre 2005, à Madrid.

Conférences, colloques, séminaires

Emploi de chaînes de Markov régulées pour l'analyse de séquences biologiques. N. Vergne. SSB (Statistics for Systems Biology) Novembre 2004, à jouy-en-Josas.

Les chaînes de Markov régulées. N. Vergne. Colloque Jeunes probabilistes et statisticiens. Mai 2006, à Aussois.

Les chaînes de Markov régulées : Dérive polynomiale. N. Vergne. Séminaire au Service de Conformation des Macromolécules Biologiques et de Bioinformatique. Juin 2006, à Bruxelles.

Les modèles de Markov régulés pour l'étude de séquences biologiques : Dérive polynomiale et applications. N. Vergne. 6èmes Journée Jeunes Chercheurs en Biométrie. Septembre 2006, à Villejuif.

Chaînes de Markov régulées pour l'analyse de séquences biologiques. N. Vergne. Séminaire de l'Unité MIA-Jouy (INRA). Octobre 2008, à Jouy-en-Josas.

Chaînes de Markov régulées pour l'analyse de séquences biologiques. N. Vergne. Séminaire Marin Mersenne - Samos, Mathématiques des Systèmes Complexes. Octobre 2008, Université Paris I.

Poisson approximation for search of rare words in DNA sequences. N. Vergne. Workshop on "Hitting, returning and matching in dynamical systems, information theory and mathematical biology". Novembre 2008, Eurandom (Eindhoven).

Rates of Phylogenetic and supervised Classification Algorithms in DNA Barcoding. C. Larédo, N. Vergne, F. Austerlitz, O. David, B. Schaeffer, K. Bleakleyand and M. Veuille. "Third International Barcode of Life Conference". Novembre 2009, à Mexico.

Méthode bayésienne de classification des séquences Barcode basée sur la coalescence. N. Vergne. Journées MAS. Septembre 2010, à Bordeaux.

Chaînes de Markov régulées pour l'analyse de séquences biologiques. N. Vergne. 4ème Journée de la Fédération Normandie-Mathématiques. Juin 2012, Université de Rouen.