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Master Sciences Technologies Santé - Mention Biologie Santé


BioInforMatique

une spécialité Professionnelle et Recherche

 région haute Normandie


Exemples de stages de M1

 

 Julien et Thibaut : Modélisation moléculaire
Etude structurale par RMN et Modélisation moléculaire d'un peptide
Méthodes  :  RMN - Attribution de spectres
UMR 6014 CNRS, Rouen
Céline : Transcriptomique chez l'homme

Recherche de gènes biomarqueurs d'états cancéreux dans les cancers surrénaliens.
Méthodes : qRT-PCR par carte microfluidique, analyses statistiques, analyses bioinformatiques
U413 INSERM, Univ. Rouen
Pascale : Protéomique végétale

Méthodes  :  électrophorèse 2D,  spectrométrie de masse, analyses bioinformatiques .
CNRS UMR6037,  Univ. Rouen
 Edouard : Génomique des insectes

Validation + des prédictions des gènes d'une famille de protéases par RT-PCR chez Anopheles gambiae et analyse phylogénétique .
Méthodes  : RT-PCR, phylogénie moléculaire
Institut Pasteur,  Paris
Michèle : Génomique végétale

Polyploïdie et adaptation des plantes: Etude de l’expression de gènes homéologues chez le caféier 
Méthodes :  dessin d'amorces de PCR, qRT-PCR, analyses bioinformatiques.
UMR-RPB (CIRAD-IRD-UMII),  Montpellier
Sophie : écologie microbienne

Analyse phylogénétique d'une population bactérienne de Pseudomonas dans les sols.
Méthodes : conjugaison, phylogénie moléculaire
LMDF, Univ. Rouen
Julie : Génomique des nématodes

Analyse de la diversité génétique d'un ver télurique .
Méthodes : isolement de microsatellites, génotypage par PCR, analyses bioinformatiques.
Université de Jyvaskyla,  Finlande
ERASMUS

 Olivier : Cartographie génétique végétale

Densification en marqueurs moléculaires d’un groupe de liaison chez le colza et recherche de polymorphisme entre deux espèces proches;
Méthodes  : dessin d'amorces PCR,  génotypage par PCR de microsatellites, recherche de synthénie
UMR 118 INRA, Rennes
Juliette : Oncologie moléculaire

Mise au point d’une nouvelle technique de détection des mutations d'un gène par « High Resolution Melting » .
Méthodes  : HRM, typage d'ADN tumoral.
Inserm U614, Univ. Rouen
 Julie : Protéomique chez l'homme

Etude des protéines régulées par des neuropeptides au cours de la différenciation de cellules;
Méthodes  :  Protéomique par chromatographie liquide 2D et spectrométrie de masse, analyses bioinformatiques .
INSERM U413, Univ. Rouen
   Germain : Transcriptomique chez l'homme

Comparaison de transcriptomes hépatiques selon deux étiologies pathologiques.
Méthodes  : macro-array, analyses bioinformatiques,  classification.
U519 INSERM, Univ.Rouen
 Grégory : Transcriptomique chez l'homme

Analyse de la voie de signalisation de deux gènes dans les tumeurs de vessie humaine.
Méthodes:micro-array, voie de signalisation,  analyses bioinformatiques ,  classification 
UMR144 CNRS Institut Curie, Paris
  Cédric :  Transcriptomique chez le rat

Analyse transcriptomique de facteurs environnementaux dans l'émergence du syndrome de Parkinson chez le rat

Méthodes: micro-array, analyses bioinformatiques, analyse des voies de régulation.
Unité EA2683 , Univ. Lille
 Philippe : Protéomique chez l'homme

Mises au point d'électrophorès 2D en vue de l'obtention de profils d'expression protéomique .
Méthodes  :  chromatographie, spectrométrie de masse, analyses bioinformatiques .
UMR 6522 CNRS Univ. Rouen
Stéphanie : Modélisation par RMN

Etude structurale et fonctionnelle du domaine N-terminal d'une protéine.
Méthodes  :  RMN - South-Western,
CEA, Saclay
 Johanna : Génomique végétale

Annotation du génome d'une algue
CNRS UMR6037,  Univ. Rouen
Paul :  Immuno- Protéomique
Méthodes  :  électrophorès 1D, programmation et analyses statistiques des profils de profils.
U519 INSERM, Univ.Rouen



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