Mlle Helene DAUCHEL
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| Discipline | Biochimie et biologie moléculaire | | Corps | Maitre de conferences | | Fonction(s) | resp. spécialité "BioInforMatique" du Master "BioSciences" (ex Biologie Santé) | | Mél | Helene.Dauchel@univ-rouen.fr |
Coordonnées principales
| | Affectation | Ufr sciences techniq - dpt biologie | | Tél | +33 2 35 14 63 89 | | Fax | (33) 2 35 14 71 40 |
Autres Coordonnées
| | Affectation | Ea4108 | | Bureau | Lab. LITIS EA 4108 1er étage bât Monod n°22 | | Tél | (+33) 2 35 14 63 89 | | Fax | (+33) 2 35 14 71 40 |
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Discipline enseignéeBiologie :
L3 SVTE Sciences de la Vie de la Terre et de l'environnement
Master (M1 et M2) Biologie Santé; spécialité BioInforMatique
- Génétique moléculaire
- Génomique
- Transcriptomique
- Evolution des génomes et génomique comparative
- Bioinformatique moléculaire et fonctionnelle |
Thèmes de rechercheAu sein de l'équipe TIBS (Traitement de l'Information en Biologie Santé) du LITIS : Bioinformatique et Analyse des génomes.
* Génomique comparative et redondances génomiques : Développement d'une plateforme multi-outils de génomique comparative pour l'analyse des répétitions intra-génomiques et pour la comparaison inter-génomique.
* NGS (Nouvelle Génération de Séquençage) et analyse des variations génétiques d'Exomes humains pour la recherche de gènes candidats à une pathologie. |
Curriculum VitaeI'm an Assistant Professor in the Department of Biology at the University of Rouen (Normandy, France), since September 1994. My current courses are in molecular genetics, genomics and bioinformatics. Since 1999, I'm the director of the Bioinformatics MSc of University of Rouen, hence contributing to the education effort of engineers and researchers in genomics and bioinformatics for prominent institutions in France, in Europe and Canada. http://masterbioinfo.formations.univ-rouen.fr/
Before that, I graduated with a BSc and MSc in Biochemistry, from University of Rouen (1987) and from the University of Paris VI (1988) respectively, with a major in Immunology (best of my year). I conducted my graduate training and PhD in Immunopathology at the University of Rouen as a fellow of the Research and Technology French Ministery and I received my PhD in 1993. Using biochemical, cellular and clinical approaches, I studied differential expression of the alternative pathway complement system proteins in activation of the vascular endothelium during inflammation and their control by synthetic glucocorticoid.
Then, as assistant professor I joined in 1994 a plant biology laboratory in Rouen University, developing molecular approaches in order to clone and to explore the expression of pectine methylesterase genes during cell wall growth in the flax model. In parallel of wet experimental approaches, I started gradually a transversal approach to conduct functionnal explorations of this multigenic family with bioinformatics methods.
Since 2001, I joined a pluridisciplinary research team of bioinformaticians and biostatisticians working in comparative genomics area. I participate to develop a convivial multi-tools platform and new algorithmics and statistical methods dedicated to the detection of tandem and dispersed repeats in completely sequenced genomes. I'm starting now a research program focused on the development of an innovating analytic tool, in order to help biomedical researchers to generate useful knowledge from exome variations sequence data (NGS). EVA (Exome Variation Analyser) is a friendly interfaced tool for filtering strategies in medical genomics (http://litis.insa-rouen.fr/EVA/). It has been successfully identify a candidate gene in a rare form of Alzeihmer disease.
Liste de publications : visiter ce lien
Organisation de Rencontres scientifiques :
- 2004-2005-2007 : Organisation des rencontres internationales BIM-IT (BioInforMatics International Tour du Master de BioInforMatique)", Genève-Lausanne (CH), Cambridge (UK, Washington(USA);
- 2007 : Organisation forum" Activités innovantes, jeunes pousses et bioinformatique", Rouen ;
- 2006: Organisation du Workshop ENSEMBL(EBI), Rouen;
- 2005 : membre du comité scientifique des JOBIM (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques), de la Société Française de BioInformatique (SFBI), Lyon.
Fonctions :
- Depuis 1998 : Responsable du Master BioInforMatique en alternance et apprentissage de l'Université de Rouen.
- Depuis 1994 : Enseignante-chercheure au Département de Biologie de la Faculté des Sciences et Techniques de l'Université de Rouen.
- 1992-1994: Attachée Temporaire d'Enseignement et de Recherche (ATER), département de Biologie, Université de Rouen.
- 1990-1992: Monitrice-Allocataire de Recherche du Ministère de la Recherche et de Technologie, département de Biologie, Université de Rouen.
Titres universitaires :
- 1993 : Doctorat de Biologie Cellulaire et Moléculaire, spécialité Immunologie. "Le système du complément et la cellule endothéliale: biosynthèse in vitro des protéines de la voie alterne et activation pathologique au cours des vascularites leucocytoclasiques", soutenu le 9 Septembre 1993 à l'U78 de l'INSERM "Complément et Inflammation" (Dir. Dr M. Fontaine), Université de Rouen. (Rapporteurs: Pr M. Kazatchkine et Dr J. Wietzerbin. Président Jury : Pr F. Tron)
- 1989 : DEA de Biologie Cellulaire, spécialité Immunologie, Université de Rouen
- 1988 : Maîtrise de Biochimie et Immunologie, UPMC Paris VI
- 1987 : Licence de Biochimie et Microbiologie, Université de Rouen |
Compléments Autres fonctions :
- Membre élu du conseil du département de Biologie (2008-2012);
- Membre élu au conseil de perfectionnement du Centre de Formation par Apprentissage de l'Université de Rouen (en cours);
- Membre de plusieurs comités de sélection aux concours MCU 64è (depuis 2009)
- Membre élu de la commission de spécialistes 64-65ème section (2 mandats);
- Membre élu du conseil scientifique de l'UFR Sciences et Techniques (2 mandats)
- Membre élu du conseil scientifique de l'Université de Rouen (2 mandats);
- Porteuse du projet et initiatrice de la mission "Egalité des chances entre les femmes et les hommes" à l'université de Rouen (Projet FSE- MRT).
Actions de vulgarisation scientifique :
- Sciences en fêtes
- Conférences en lycée et parrainages
- Conférence interne à l'Université de Rouen ("30 min pour comprendre") |
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